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#21 RE: Die epigenetische Altersuhr von jayjay 13.05.2016 00:36

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Hi,
ich denke das diese CRISPR Technologie ein gutes Werkzeug ist um die Epigenetik zu erforschten. Vielleicht wird auch dieses "Programm" entschlüsselt. Vielleicht entdeckt man auch das die Epigenetik viel komplexer ist, als man sich nach jetztigem Wissen vorstellen kann. Vielleicht kann dieses CRISPR mir auch endlich sagen ob nach einer Zellteilung die DNA wieder gleich um die Histone gewickelt wird (alte Frage ). Ich denke die Lage der DNA hätte Auswirkungen auf ihre Funktionsweise.
Wenn man denn irgendwann weiß, was zu verändern wäre, um länger zu Leben, wie sollte man diese Information/Informationen in all die verschiedenen Zellen schleusen? Ich denke halt jedes Gewebe braucht andere Infos. Aber vielleicht gibt's doch eine Info die alle Zellen verjüngt.

#22 RE: Die epigenetische Altersuhr von Prometheus 13.05.2016 22:35

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@jayjay

Zitat
Wenn man denn irgendwann weiß, was zu verändern wäre, um länger zu Leben, wie sollte man diese Information/Informationen in all die verschiedenen Zellen schleusen?



Genau das ist mit CRISPR-Systemen grundsätzlich möglich.

Mit CRISPR werden definitiv in den nächsten Jahren die ersten klinischen Therapieversuche starten (RE:News aus der Forschung).

Trotzdem ist Vorsicht geboten, man kann mit Sicherheit auch viel "verschlimmbessern". Man ist jetzt noch weit davon entfernt, die Auswirkungen von gezielten genetischen oder epigenetischen Eingriffen zu verstehen.

Daher denke ich, dass eine persönliche Datenbank für eigene "junge" Gewebeproben in den nächsten Jahrzehnten eine sehr wertvolle Investition ist:

Blut einlagern

Der Vorteil: Dann hat man eine funktionierende "Vorlage", an der man sich orientieren kann.

#23 RE: Die epigenetische Altersuhr von Prometheus 18.05.2016 20:11

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Nochmal Josh Mitteldorf:


"The body is programmed to die, and its suicide plan is laid out in the form of transcribing an unhealthy combination of genes. This idea flies in the face of traditional evolutionary theory. (How could natural selection prefer a genome that destroys itself and cuts off its own reproduction?) Nevertheless, the evidence for this hypothesis is robust. The genes that are turned on don’t protect the body—quite the opposite. Genes for inflammation are dialed up. Genes for the body’s defense against free radicals are dialed down. Cell turnover is dialed down. DNA repair is dialed down. The mechanisms of programmed cell death (apoptosis) are strengthened in healthy cells, at the same time that they are perversely weakened in cells that are a threat to the body, like infected cells and cancer cells."

[...]

"But the ultimate experiment will be to re-program gene expression in an old mouse and see if there is a rejuvenating effect."

[...]

"Here’s my proposed program:

1.Repeat Horvath’s (human) analysis for mice. [Damit meint er die Bestimmung des epigenetischen Alters, siehe z.B. Hier] In other words, identify several hundred places where methylation is different in young and old mice.
2.Determine which genes are associated with these regions. (Map needed for this should already be available.)
3.Look at the set of genes and identify transcription factors. These are likely to be “upstream”, in that they control other genes.
4.Start with old mice. Use CRISPR to change the methylation status in a handful of promoter regions that control transcription factors, making them match the methylation status of young mice.
5.Measure metabolic functions to see if the old mice are more healthy or less after these procedures. Look particularly for changes in inflammation, propensity for cancer, and especially life span.


If this experiment goes as I expect, we will be ready for rejuvenation experiments in humans."


Epigenetics of Aging, and Prospects for Rejuvenation
http://joshmitteldorf.scienceblog.com/20...r-rejuvenation/

#24 RE: Die epigenetische Altersuhr von La_Croix 11.06.2016 13:45

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Zitat
Trotzdem ist Vorsicht geboten, man kann mit Sicherheit auch viel "verschlimmbessern". Man ist jetzt noch weit davon entfernt, die Auswirkungen von gezielten genetischen oder epigenetischen Eingriffen zu verstehen.



Mit C2C2, könnte man zuerst mla austesten, wie sich eine Manipulation auswirken würde!

CRISPR: Ein Tor zu neuen Anwendungen
Forscher setzen die molekulare Schere auf RNA an
Boston/Wien – Es vergeht ja kaum eine Woche ohne neue Studien über Anwendungsmöglichkeiten der Genschere CRISPR, die für Krankheiten verantwortliche Genstrukturen austauschen kann und daher als Hoffnung für zukünftige medizinische Anwendungen gilt. Bisher wurde CRISPR für Veränderungen der DNA eingesetzt. Der große Unterschied: Wird die RNA solcherart modifiziert, sind die Änderungen nicht bleibend. Bei DNA-Anwendungen wird ins Genom eingegriffen, das Ergebnis ist also irreversibel. RNA-Anwendungen lassen laut einem aktuellen Paper, das im Fachjournal "Science" erschien, auch leichtere Anpassungen zu. Die Arbeit kommt von einem Team um Feng Zhang vom Broad Institute der Harvard University und des MIT, der, wie berichtet, mit den Entdeckerinnen von CRISPR, der französischen Molekularbiologin Emmanuelle Charpentier und der US-amerikanischen Strukturbiologin Jennifer Doudna, in einen Patentstreit verwickelt ist. Die Wissenschafter haben das Enzym C2c2 als erstes CRISPR-System identifiziert, das nur die RNA angreift und entsprechend programmiert werden kann. Zhang wird mit überschwänglichen Worten zitiert: "C2c2 öffnet uns ein Tor zu neuen, mächtigen CRISPR-Werkzeugen. Es gibt hier enorme Möglichkeiten für die Anwendung." Was der Wissenschafter meint, liegt auf der Hand: Die CRISPR-Anwendung auf RNA könnte zu Medikamenten führen, die lebenslang eingenommen werden müssten, aber bei eventuellen Nebenwirkungen ohne weitreichende, bleibende Folgen für den Patienten auch jederzeit abgesetzt werden könnten. Die Pharmaindustrie wird sich diese Chance mit Sicherheit nicht entgehen lassen, sagen Beobachter. Technologisch scheint das Paper für die Grundlagenforschung sehr interessant zu sein, "da wir immer wieder nach Methoden suchen, bestimmte RNAs selektiv zu reinigen, um deren Komplexe zu analysieren. Dies kann mit einem mutierten C2c2-Protein gemacht werden", sagt Michael Jantsch, Leiter des Zentrums für Anatomie und Zellbiologie der Med-Uni Wien. - derstandard.at/2000038114988/CRISPR-Ein-Tor-zu-neuen-Anwendungen.

http://derstandard.at/2000038114988/CRIS...uen-Anwendungen

#25 RE: Die epigenetische Altersuhr von Prometheus 20.06.2016 23:33

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Bei der Messung des epigenetischen Altes zeigt sich dass die Messung das biologische Alter misst und nicht das chronologische Alter:


DNA methylation levels at individual age-associated CpG sites can be indicative for life expectancy
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4789590/

DNA methylation age is associated with mortality in a longitudinal Danish twin study.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26594032

#26 RE: Die epigenetische Altersuhr von La_Croix 19.08.2016 22:22

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Epigenetics and aging

Over the past decade, a growing number of studies have revealed that progressive changes to epigenetic information accompany aging in both dividing and nondividing cells. Functional studies in model organisms and humans indicate that epigenetic changes have a huge influence on the aging process. These epigenetic changes occur at various levels, including reduced bulk levels of the core histones, altered patterns of histone posttranslational modifications and DNA methylation, replacement of canonical histones with histone variants, and altered noncoding RNA expression, during both organismal aging and replicative senescence. The end result of epigenetic changes during aging is altered local accessibility to the genetic material, leading to aberrant gene expression, reactivation of transposable elements, and genomic instability. Strikingly, certain types of epigenetic information can function in a transgenerational manner to influence the life span of the offspring. Several important conclusions emerge from these studies: rather than being genetically predetermined, our life span is largely epigenetically determined; diet and other environmental influences can influence our life span by changing the epigenetic information; and inhibitors of epigenetic enzymes can influence life span of model organisms. These new findings provide better understanding of the mechanisms involved in aging. Given the reversible nature of epigenetic information, these studies highlight exciting avenues for therapeutic intervention in aging and age-associated diseases, including cancer.

http://advances.sciencemag.org/content/2/7/e1600584


Blood Epigenetic Age may Predict Cancer Incidence and Mortality
http://www.sciencedirect.com/science/art...352396416300421

#27 RE: Die epigenetische Altersuhr von La_Croix 19.08.2016 22:32

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Epigenetic age acceleration predicts cancer, cardiovascular, and all-cause mortality in a German case cohort

Previous studies have developed models predicting methylation age from DNA methylation in blood and other tissues (epigenetic clock) and suggested the difference between DNA methylation and chronological ages as a marker of healthy aging. The goal of this study was to confirm and expand such observations by investigating whether different concepts of the epigenetic clocks in a population-based cohort are associated with cancer, cardiovascular, and all-cause mortality.

https://clinicalepigeneticsjournal.biome...3148-016-0228-z





DNA methylation levels at individual age‐associated CpG sites can be indicative for life expectancy
DNA-methylation (DNAm) levels at age-associated CpG sites can be combined into epigenetic aging signatures to estimate donor age. It has been demonstrated that the difference between such epigenetic age-predictions and chronological age is indicative for of all-cause mortality in later life. In this study, we tested alternative epigenetic signatures and followed the hypothesis that even individual age-associated CpG sites might be indicative for life-expectancy. Using a 99-CpG aging model, a five-year higher age-prediction was associated with 11% greater mortality risk in DNAm profiles of the Lothian Birth Cohort 1921 study. However, models based on three CpGs, or even individual CpGs, generally revealed very high offsets in age-predictions if applied to independent microarray datasets. On the other hand, we demonstrate that DNAm levels at several individual age-associated CpGs seem to be associated with life expectancy - e.g., at CpGs associated with the genesPDE4C and CLCN6. Our results support the notion that small aging signatures should rather be analysed by more quantitative methods, such as site-specific pyrosequencing, as the precision of age-predictions is rather low on independent microarray datasets. Nevertheless, the results hold the perspective that simple epigenetic biomarkers, based on few or individual age-associated CpGs, could assist the estimation of biological age.

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26928272

#28 RE: Die epigenetische Altersuhr von La_Croix 26.09.2016 20:48

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Identifizierung von epigenetischen Masterregulatoren der Alterung im humanen hämatopoietischen System

http://docserv.uni-duesseldorf.de/servle...20Graffmann.pdf




Einfluss bakterieller Erreger auf das Epigenom und die Seneszenz von Wirtszellen

http://www.diss.fu-berlin.de/diss/servle...nxen_online.pdf

#29 RE: Die epigenetische Altersuhr von La_Croix 29.09.2016 14:37

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Internal 'clock' makes some people age faster and die younger – regardless of lifestyle
Study could explain why even with healthy lifestyles some people die younger than others, and raises future possibility of extending the human lifespan

Scientists have found the most definitive evidence yet that some people are destined to age quicker and die younger than others - regardless of their lifestyle.
The findings could explain the seemingly random and unfair way that death is sometimes dealt out, and raise the intriguing future possibility of being able to extend the natural human lifespan.
“You get people who are vegan, sleep 10 hours a day, have a low-stress job, and still end up dying young,” said Steve Horvath, a biostatistician who led the research at the University of California, Los Angeles. “We’ve shown some people have a faster innate ageing rate.”
A higher biological age, regardless of actual age, was consistently linked to an earlier death, the study found. For the 5% of the population who age fastest, this translated to a roughly 50% greater than average risk of death at any age.
Intriguingly, the biological changes linked to ageing are potentially reversible, raising the prospect of future treatments that could arrest the ageing process and extend the human lifespan.
“The great hope is that we find anti-ageing interventions that would slow your innate ageing rate,” said Horvath. “This is an important milestone to realising this dream.”

https://www.theguardian.com/science/2016...ss-of-lifestyle




DNA methylation-based measures of biological age: meta-analysis predicting time to death
Estimates of biological age based on DNA methylation patterns, often referred to as "epigenetic age", "DNAm age", have been shown to be robust biomarkers of age in humans. We previously demonstrated that independent of chronological age, epigenetic age assessed in blood predicted all-cause mortality in four human cohorts. Here, we expanded our original observation to 13 different cohorts for a total sample size of 13,089 individuals, including three racial/ethnic groups. In addition, we examined whether incorporating information on blood cell composition into the epigenetic age metrics improves their predictive power for mortality. All considered measures of epigenetic age acceleration were predictive of mortality (p≤8.2x10-9), independent of chronological age, even after adjusting for additional risk factors (p<5.4x10-4), and within the racial/ethnic groups that we examined (non-Hispanic whites, Hispanics, African Americans). Epigenetic age estimates that incorporated information on blood cell composition led to the smallest p-values for time to death (p=7.5x10-43). Overall, this study a) strengthens the evidence that epigenetic age predicts all-cause mortality above and beyond chronological age and traditional risk factors, and b) demonstrates that epigenetic age estimates that incorporate information on blood cell counts lead to highly significant associations with all-cause mortality.

http://www.aging-us.com/article/a4YqjiSauBRXHwfiX

#30 RE: Die epigenetische Altersuhr von La_Croix 29.09.2016 19:56

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Aging and DNA methylation
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4311512/





Polycomb repressive complex 2 epigenomic signature defines age-associated hypermethylation and gene expression changes
http://www.tandfonline.com/doi/full/10.1...94.2015.1040619




Epigenetic regulation of ageing: linking environmental inputs to genomic stability
Ageing is affected by both genetic and non-genetic factors. Here, we review the chromatin-based epigenetic changes that occur during ageing, the role of chromatin modifiers in modulating lifespan and the importance of epigenetic signatures as biomarkers of ageing. We also discuss how epigenome remodelling by environmental stimuli affects several aspects of transcription and genomic stability, with important consequences for longevity, and outline epigenetic differences between the 'mortal soma' and the 'immortal germ line'. Finally, we discuss the inheritance of characteristics of ageing and potential chromatin-based strategies to delay or reverse hallmarks of ageing or age-related diseases.

http://www.nature.com/nrm/journal/v16/n10/pdf/nrm4048.pdf




Histone methylation makes its mark on longevity
How long organisms live is not entirely written in their
genes. Recent findings reveal that epigenetic factors that
regulate histone methylation, a type of chromatin mod-
ification, can affect lifespan. The reversible nature of
chromatin modifications suggests that therapeutic tar-
geting of chromatin regulators could be used to extend
lifespan and healthspan. This review describes the epi-
genetic regulation of lifespan in diverse model organ-
isms, focusing on the role and mode of action of
chromatin regulators that affect two epigenetic marks,
trimethylated lysine 4 of histone H3 (H3K4me3) and
trimethylated lysine 27 of histone H3 (H3K27me3), in
longevity.

http://web.stanford.edu/group/brunet/Shuo%20Han%202012.pdf





Age-Related Increase of EED Expression in Early Hematopoietic Progenitor Cells is Associated with Global Increase of the Histone Modification H3K27me3.
Human hematopoietic stem and progenitor cells (HSPCs) from umbilical cord blood exhibit higher differentiation potential and repopulation capacity compared to adult HSPCs. The molecular basis for these functional differences is currently unknown. Upon screening for epigenetic effector genes being differentially expressed in neonatal and adult HSPC subpopulations, the Polycomb Repressive Complex 2 (PRC2) member EED was identified. Even though EED is expressed at comparable amounts in neonatal and adult multipotent HSPCs, early adult lineage committed progenitors of the lymphomyeloid (LM) and erythromyeloid lineages expressed higher EED amounts than neonatal HPCs. We demonstrate that EED overexpression directly leads to higher H3K27me3 levels, a repressive histone modification that is mediated by the PRC2 complex. Quantitative analysis of H3K27me3 levels by FPLC-based ELISA revealed elevated levels in primary blood cells from adults. Besides quantitative changes, gene ontology analysis of the genome-wide H3K27me3 distribution revealed qualitative changes in adult HSPCs with elevated levels in genes associated with nonhematopoietic development pathways. In contrast, H3K4me3 which labels active chromatin was enriched on hematopoietic genes. In vitro differentiation of EED-transfected neonatal HSPCs revealed aberrant expression of the myelopoietic marker CD14, suggesting that EED affects the lymphoid versus myeloid decision processes within the lymphomyeloid lineage. This is in line with LM progenitors having the most pronounced differences in EED expression. Highlighting the dynamic roles of epigenetic modifications in human hematopoiesis, the present data demonstrate shifts in the PRC2-associated histone modification H3K27me3 from birth to adulthood.

http://online.liebertpub.com/doi/10.1089/scd.2014.0435

#31 RE: Die epigenetische Altersuhr von Prometheus 10.10.2016 12:27

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Eine aktuelle Übersichtsarbeit zum Thema Epigenetik und Alterung:

Epigenetic Mechanisms of Longevity and Aging

Zitat
This review provides a comprehensive overview of the compelling epigenetic evidence linked to aging from animal, tissue, and cell-based models that continue to be critical for identifying key longevity pathways. Studies of chromatin changes suggest two recurring themes in aging: (1) global upregulation of activating marks and downregulation of repressive marks and (2) gene-specific changes in chromatin states regulating expression of key longevity genes. These general themes are heavily influenced by environmental stimuli, nutrient signaling, and metabolic state.



http://www.sciencedirect.com/science/art...092867416310005

#32 RE: Die epigenetische Altersuhr von Prometheus 10.10.2016 13:13

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Aus dem letzten Blogeintrag von Vince Guilliano gibt es enorm ausführliche Informationen zum Alterungs-Methylom.
Die beiden Autoren haben dafür sicherlich einige Monate recherchieren müssen!

In dem Blogeintrag wird noch einmal ausführlich auf die biochemischen Grundlagen eingegangen. Vorsicht: Mit dem Blogeintrag kann man sich ziemlich lange beschäftigen... Daher für einen kleinen Überblick hier einige "Highlights":

Zitat
Chimpanzees, Bonobos, and humans share the same epigenetic clock, as shown by Horvath’s elastic net regression algorithm that agnostically chose 353 CpGs, whereas Gotillas did not share this clock (too distant from humans in evolution). This goes against environmental factors and extrinsic factors as the “cause” of aging, and suggests that the pattern of aging may be programmed and heritable across different species (I.e. It is genus/family-specific type of programmed aging).



Wenn man schaut, ob die epigenetische Uhr des Menschen auch bei Affen tickt, zeigt sich dass sie auch für Schimpansen und Bonobos gilt, nicht aber für Gorillas. Das ist ein gutes Argument, dass die Altersuhr tatsächlich genetisch angelegt ist und nicht von Umweltfaktoren hervorgerufen wird.

Zitat
Age, Cancer and Inflammation-associated hypermethylation occurs at Polycom Group Protein target genes and may be the “quasi-program of aging”



Hypermethylierungen bei Alterung, Krebs und Entzündung konzentrieren sich programmartig auf einige Genbereiche, die man sich als epigenetische Weichensteller vorstellen kann.

Zitat
It appears that inflammation may be responsible for this age-related DNA hypermethylation face, that is hypermethylation of promoter sites of GpC islands . Specifically, the inflammatory cytokine IL-6 “drives” age-related epigenetic hypermethylation [...]Circadian cortisol secretion (HPA axis) appears to play a major role in the DNA hypomethylation face of “epigenetic aging”.



Die CpG-Hypermethylierungen werden maßgeblich durch Entzündungen verstärkt, für die genomweiten Hypomethylierungen spielen die circadianen Cortisol-Werte eine entscheidende Rolle

HALT: Das ist eine WICHTIGE Information - Bitte noch mal eine Zeile zurückgehen! Da stehen die beiden zentralen Ansatzpunkte gegen das epigenetische Altern!

Und hier die vorsichtigen Schlussfolgerungen von Vince Guilliano:

Zitat
There are two major observed DNA methylation trends observed with advancing age: 1. Global hypomethylation of CGIs in non-promoter sites. This leads to expression of many genes we would not like to see over-expressed such as oncogenes and pro- inflammatory genes, and it likely leads to over expression of transposable elements. The consequence can be dysregulation of protein expression leading to diseases of old age, essentially all of which are inflammatory in origin. And, 2. Selective hypermethylation of CGIs of promoters for health-maintaining genes, such as ones that limit inflammation and carcinogenic processes. This turns off genes that produce protective proteins, again opening the door for many diseases of old age.

We can do some things to possibly mitigate both trends. Here are a few ideas in a nutshell, ones I personally pursue.

1, Global hypomethylation: In Item 12 of Section B and in Item 2 of Section C above we discussed the role of cortisol and dysregulation of circadian rhythms in inducing global DNA hypomethylation. We talked about how cortisol can induce expression of TET enzymes that induce hypomethylation. This suggests that with aging certain hormone supplements might be useful, namely melatonin at bedtime to help stablilize the circadian cycle and DHEA supplementation which antagonizes cortisol expression. The ratio of DHEA and cortisol appears to be quite important. Also suggested is possible supplementation with pregnenalone, a “mother” hormone for both cortisol and DHEA. And I believe long regular sleep can help offset the circadian dysregulation often experienced by people in their 80s and above.

Failure to maintain the silence of repetitive sequences of DNA can also by a consequence of global hypomethylation. See Item 7 in Section B and Item 3a in Section E, As pointed out, the gene for the DNA methyltransferase 1 (DNMT1) which works during the S-phase of the cell cycle is down-regulated with aging and its working is dependent on the availability of an adequate supply of methyl doner molecules. Therefore, supplementation with Vitamin B12 and folic acid might be a good strategy

2. Selective hypermethylation: In Items 10 and 11 of Section B we explained how Polycomb protein Complex target genes become hypermethylated in both aging and cancer the link being inflammation. Item 12 in Section B discusses how chronic stress can lead to accelerated aging via age-assocated DNA methylation. We discussed this further in Item 1 of Section C and specifically talked about how the inflammatory cytokine IL-6 “drives” age-related epigenetic hypermethylation, As I have often written, we know that chronic inflammation is at the heart of essentially all killer diseases related to aging. Therefore this finding with respect to selective DNA hypermethylation lends additional weight to strategies for control of chronic inflammation, The topic of chronic inflammation is very complex. While inflammation is an essential natural process, chronic inflammation can have many possible causes. And there are many possible strategies for dealing with it. Jim Watson and I are currently planning a series of blog entries on chronic inflammation, and they should soon begin to appear. What I mention here is only a few points that have been highly important for me both professionally and personally: a) that strategies for controlling age-related inflammation do exist and can be highly effective, b) I have come to believe supplementation with certain traditional well-studied herbs together with observing some simple dietary and lifestyle rules can be a highly effective approach for controlling several pernicious forms of chronic inflammation, and c) that with colleagues I have developed a liposomal (high bioavailability) preparation of four powerful anti-inflammatory herbal extracts that I and others have been consuming for three years now, and this should soon should be available commercially.



Kommentar Prometheus:

  • Sorge für einen guten Circadianen Rhythmus, um die globalen Hypomethylierungen zu verhindern
  • Kümmere dich um chronische Entzündungen und die Entzündungsalterung, um die CpG-Hypermythlierungen aufzuhalten


Aging, health and disease – view from the DNA Methylome
http://www.anti-agingfirewalls.com/2016/...-dna-methylome/

#33 RE: Die epigenetische Altersuhr von Prometheus 25.11.2016 16:08

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Progress on the role of DNA methylation in aging and longevity

"An abundance of evidence indicates that reversal of aberrant DNA methylation could be an effective strategy to suppress disease and promote longevity [...]

It is well-known that DNA methylation is a reversible epigenetic modification. Currently, emerging evidence suggests that certain interventions (e.g. CR, dietary supplementation and chemical drugs) can prevent age-related diseases and promote longevity, at least in part, through reversing the aberrant age-associated changes in DNA methylation, suggesting the great potential of DNA methylation in therapeutic strategies against age-related diseases."

Key Points

•DNA methylation plays crucial roles in regulating gene transcription.
•A globally decreased and site-specific increased DNA methylation occurs in aging.
•The age-associated change in DNA methylation is one cause for the increased risk of age-related diseases.
•Reversal of aberrant DNA methylation may be one potential strategy to suppress disease and promote longevity.



http://bfg.oxfordjournals.org/content/ea...fgp.elw009.full

#34 RE: Die epigenetische Altersuhr von La_Croix 08.03.2017 10:28

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Epigenom-Forschung
Ein neuer Dreh in der Epigenetik

Wie wiederentdeckte chemische Marker an DNA und RNA die Genexpressionsforschung aufrütteln.


Zitat
Eins ist allerding klar: m6A spielt eine grundlegende Rolle bei der Zelldifferenzierung, denn Zellen ohne diese Markierung bleiben in ihrer Entwicklung in einem stammzell- oder vorläuferzellähnlichen Stadium stecken. Dies kann tödlich enden: Als He und Kollegen etwa den m6A-Schreiber bei Mäusen inaktivierten, starben viele Embryos bereits in der Gebärmutter.

Für die Funktion von m6A liefert He eine mögliche Erklärung. Immer wenn eine Zelle von einem Stadium in ein anderes übergeht, wie etwa während des Differenzierungsprozesses, müssen sich auch ihre mRNAs verändern. Diese Variation des mRNA-Gehalts, die He mit dem Begriff "Transkriptom-Switch" (zu Deutsch etwa "Transkriptom-Schalter") umschreibt, erfordert Präzision und sorgfältiges Timing. Die Methylmarkierungen könnten den Zellen die Möglichkeit verschaffen, die Aktivität von mehreren tausend Transkripten zu synchronisieren, meint He.


http://www.spektrum.de/news/ein-neuer-dr...genetik/1440214

Die Infos aus dem Artikel hören sich stark danach an, als würde auch die Methylierung von Adenosin eine entscheidende Rolle in der Alterung spielen!

Wer weiß, welche anderen Faktoren neben der Methylierung von Cytosin und Adenin sowie der Histon-Acetylierung noch am Zelldifferenzierungs- und Alterungsprogramm (ich vemute mal, die hängen stark zusammen) beteiligt sind...
Ob wir alle Faktoren in absehbarer Zeit identifizieren und auch gut genug verstehen werden?

#35 RE:Die epigenetische Altersuhr von Prometheus 15.10.2014 18:49

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Wie misst man eigentlich das biologische Alter?

Eine Lösung dieses Problems ist enorm wichtig (lebenswichtig!) denn, wenn man individuell prüfen möchte, ob Maßnahmen zur Lebensverlängerung funktionieren, benötigt man objektive Messkriterien. Alles andere kommt Kafeesatzlesen gleich!

Eine -wie ich finde- ziemlich gute Technik, die eine solche Messung leisten könnte, hatte ich hier (und im alten Forum) schon mal vorgestellt:

Man kann das biologische Alter bereits mit der Bestimmung einiger weniger Methylierungen der DNA überraschend präzise messen.
Jochen Hampe aus Tübingen hat mit Steve Horvath und seinem Team nun folgende Frage gestellt:

Wie wirkt sich Fettsucht auf den Alterungsprozess von Leberzellen aus?
Das Ergebnis ist im Grunde wenig überraschend. Wer adipös ist, hat eine vorgealterte Leber. Hätte man sich zwar auch so denken können...Aber jetzt existiert endlich ein Tool zur gewebsspezifischen Altersbestimmung, das ist die eigentliche Botschaft.

Ebenfalls eine interessante Fragestellung der Studie: Unterzieht man sich als Fettleibiger einer Magen-OP und nimmt dadurch drastisch ab, was passiert dann?
Antwort: Wer gehofft hat, dass die Leber dadurch wieder jünger wird, den muss ich leider enttäuschen. Im Detail kann man das hier nachlesen:

Obesity accelerates epigenetic aging of human liver
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=25313081

#36 Die epigenetische Altersuhr von Prometheus 06.04.2017 16:49

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Seit Jahren schreibe ich hier darüber, wie wichtig die Messung des biologischen Alters ist, um daran den Erfolg von Maßnahmen gegen das Altern MESSEN zu können.
Und das die epigenetische Altersuhr die dafür am besten geeignete Messlatte ist.

Glücklicherweise bin ich nicht der Einzige, der 1+1 zusammenzählen kann!

Hier eine brandneue Publikation, die genau diesem Gedankengang folgt:


Using DNA Methylation Profiling to Evaluate Biological Age and Longevity Interventions.
http://dx.doi.org/10.1016/j.cmet.2017.03.016

#37 RE: Die epigenetische Altersuhr von Prometheus 08.05.2020 08:38

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Anhand der Proteinzusammensetzung im Blutplasma kann man das Alter gut bestimmen:

Systematic review and analysis of human proteomics aging studies unveils a novel proteomic aging clock and identifies key processes that change with age
https://www.sciencedirect.com/science/ar...568163720300490


Viele Proteine, die sich im Alter verändern, sind direkt oder indirekt an chronischen Entzündungsreaktionen beteiligt.
Das Inflam-Aging wirkt wie eine automatische Selbstzerstörung des Körpers!

#38 RE: Die epigenetische Altersuhr von Prometheus 08.05.2020 14:29

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#37

In der Studie war es möglich, das chronologische Alter auf etwa ±4 Jahre zu bestimmen.
Das entspricht in etwa der normalen "Streubreite " des BIOLOGISCHEN Alters!
Leider bleiben die Autoren der Studie hier stehen. Für mich ist es LOGISCH, dass sich diese Proteom-Uhr hervorrragend eignet, um das biologische Alter präzise zu bestimmen.

Eine einfach per Blutabnahme erhältliche Proteom-Altersmessung wäre eine HERVORRAGENDE Möglichkeit, um Anti-Aging Maßnahmen auf ihre Effektivität zu prüfen!


Eine weitere Überlegung: Was passiert wohl, wenn man ein "Tuning"der Proteinzusammensetzung im Blut durchführen könnte, so das die Proteom-Uhr ein niedriges Alter anzeigt?

#39 RE: Die epigenetische Altersuhr von Prometheus 09.07.2020 16:11

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Die Levine-Uhr (und vermutlich auch die anderen epigenetischen Alters-Uhren) beruhen vor allem auf Proben von Menschen mit europäischer Herkunft.
Das ist eine potentielle Schwäche dieses Messinstruments, da für Menschen anderer Herkunft noch nicht gezeigt wurde, dass die Uhr dort auch akkurat misst:

Array-Based Epigenetic Aging Indices May Be Racially Biased
https://www.mdpi.com/2073-4425/11/6/685

#40 RE: Die epigenetische Altersuhr von Prometheus 28.07.2020 18:22

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Aus:
Wandering along the epigenetic timeline
https://clinicalepigeneticsjournal.biome...148-020-00893-7

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