RE: Die epigenetische Altersuhr - 7

Epigenetic clock and lifespan prediction in the short-lived killifish Nothobranchius furzeri

Zitat

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Here we set to expand these tools for the short-lived killifish, Nothobranchius furzeri. This species, with its remarkably short lifespan and expression of canonical aging hallmarks, offers a unique model for experimental aging studies.

(...)These models demonstrated high accuracy in estimating chronological age, with a median absolute error of 3 weeks (7.5% of median lifespan) for a clock based on methylation of individual CpG and 1.5 weeks (3.7% of median lifespan) for an eigenvector-based clock.

Our investigation extended to assessing epigenetic age acceleration in different strains and the potential resetting effect of regeneration on fin tissue. Notably, our models indicated that a shorter-lived strain has accelerated epigenetic aging and that regeneration does not reset, but may decelerate epigenetic aging. Additionally, we used longitudinal data to develop an “epigenetic timer” for direct prediction of individual lifespan based on fin biopsies and eigenvector-based method, achieving a median absolute error of 4.5 weeks in the prediction of actual age of death. This surprising result underscores the existence of intrinsic determinants of lifespan established early in life.

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https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.08.07.606986v1

Kommentar: Also müssten die im Median 40 Wochen leben. Da finde ich das Schätzen des Todeszeitpunkts mit 4,5 Wochen Genauigkeit im Median nicht super beeindruckend. Bei einem gesunden Menschen könnten viele anhand des Äußeren wahrscheinlich auch ungefähr einschätzen, ob er innerhalb der nächsten 8-10 Jahre sterben wird. Beeindruckender finde ich die Korrelation mit dem epigenetischen Alter per se. Wie würde es bei einem epigenetischen Reset aussehen? Trotzdem natürlich super Forschung und ein interessantes Modell.

Zitat von Prometheus im Beitrag #162

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Die 9 Parameter, die in dieser Arbeit zur Altersbestimmung verwendet wurden, sind: mittlerer arterieller Druck, glykiertes Hämoglobin, Taillenumfang, forciertes exspiratorisches Volumen in 1 Sekunde, maximaler Sauerstoffverbrauch, Adiponektin, High-Density-Lipoprotein, Gesamtcholesterin und löslicher Urokinase-Typ-Plasminogen-Aktivator-Rezeptor.

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Zitat von Prometheus im Beitrag #164

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@version2

Jain. Der Maximal mögliche Sauerstoffverbrauch ist die einzige der neun Variablen, die unmittelbar durch sportliche Aktivität beeinflusst werden kann. Die Korrelation zwischen V2OMax und der Sterblichkeit ist aber gesichert - egal ob man Sport betreibt oder nicht.

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Axolotl epigenetic clocks offer insights into the nature of negligible senescence

Zitat

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Both at tissue-specific or pan-tissue levels, the clocks are biphasic, capable of predicting age during early life but not for the rest of its lifespan. We show that axolotls exhibit evolutionarily conserved features of epigenetic ageing during early life, yet their methylome is remarkably stable across lifespan, including at Polycomb Repressive Complex 2 (PRC2) target sites, suggesting that this species deviates from known patterns of epigenetic ageing. Lastly, we uncover structure-specific rejuvenation events upon regeneration. This study provides molecular insights into negligible senescence and furthers our understanding of the interplay between regeneration and ageing.

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https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.09.09.611397v1

Zitat von version2 im Beitrag #168

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Axolotl epigenetic clocks offer insights into the nature of negligible senescence

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Ist es nicht eine allgemeine Eigenschaft von epigenetischen Altersuhren?

Zitat von version2 im Beitrag #169

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Axolotl epigenetic clocks offer insights into the nature of negligible senescence

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Zitat von Methusalem im Beitrag #170

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Ist es nicht eine allgemeine Eigenschaft von epigenetischen Altersuhren?

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Causality-Enriched Epigenetic Age Uncouples Damage and Adaptation

Zitat

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Machine learning models based on DNA methylation data can predict biological age but often lack causal insights. By harnessing large-scale genetic data through epigenome-wide Mendelian Randomization, we identified CpG sites potentially causal for aging-related traits. Neither the existing epigenetic clocks nor age-related differential DNA methylation are enriched in these sites. These CpGs include sites that contribute to aging and protect against it, yet their combined contribution negatively affects age-related traits. We established a novel framework to introduce causal information into epigenetic clocks, resulting in DamAge and AdaptAge—clocks that track detrimental and adaptive methylation changes, respectively. DamAge correlates with adverse outcomes, including mortality, while AdaptAge is associated with beneficial adaptations. These causality-enriched clocks exhibit sensitivity to short-term interventions. Our findings provide a detailed landscape of CpG sites with putative causal links to lifespan and healthspan, facilitating the development of aging biomarkers, assessing interventions, and studying reversibility of age-associated changes.

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC11070280/

Nichtuniversalität der Entzündung in der menschlichen Bevölkerung

Zitat

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Inflammaging, eine altersbedingte Zunahme chronischer Entzündungen, gilt als Kennzeichen des Alterns. Es gibt jedoch keinen Konsensansatz zur Messung der Inflammaging auf der Grundlage zirkulierender Zytokine. In dieser Arbeit untersuchten wir, ob eine im italienischen InCHIANTI-Datensatz mit 19 Zytokinen nachgewiesene Inflammaging-Achse auf eine andere industrialisierte Population (Singapore Longitudinal Aging Study) oder auf zwei indigene, nicht-industrialisierte Populationen verallgemeinert werden kann: die Tsimane aus dem bolivianischen Amazonasgebiet und die Orang Asli von der Halbinsel Malaysia.

Wir untersuchten die Ähnlichkeit der Struktur der Zytokinachse und ob die Inflammaging-Achse, die das InCHIANTI-Ergebnis repliziert, mit dem Alter zunahm oder mit gesundheitlichen Ergebnissen verbunden war. Die Singapore Longitudinal Aging Study verlief ähnlich wie InCHIANTI, mit Ausnahme von IL-6 und IL-1RA. Die Tsimane und Orang Asli zeigten deutlich unterschiedliche Achsenstrukturen mit wenig bis gar keinem Zusammenhang mit dem Alter und keinem Zusammenhang mit altersbedingten Krankheiten. Inflammaging, wie es auf diese Weise in diesen Kohorten gemessen wird, scheint daher weitgehend ein Nebenprodukt industrialisierter Lebensstile zu sein, mit großen Unterschieden zwischen Umgebungen und Populationen.

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https://www.nature.com/articles/s43587-025-00888-0

Hallo parcel,

die stille Entzündung ist ein wichtiger Biomarker für das Altern (häufig sind auch intrazelluläre Erreger beteiligt). Das Immunsystem reagiert sehr unterschiedlich auf äußere Einflüsse. Durch die Messung von hsCRP und/oder dem intrazellulären Kalziumwert kann man die stille Entzündung evtl. objektivieren.

VG

Roger

Zitat

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CRP-Referenzwerte
Normalerweise liegt der CRP-Wert im Blut unter 5 mg/l (0,5 mg/dl). Dieser Grenzwert gilt für Frauen und Männer und für alle Altersgruppen.

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Mein CRP Wert ist immer ganz niedrig (0,1mg/dl), demnach hätte ich in den letzten 20 Jahren niemals eine Endzündung gehabt. Ich lasse ihn regelmäßig messen. Ganz so kann es aber auch nicht stimmen, denn meine Augen waren ja leicht entzündet, ich leide unter trockenen Augen.

Hallo parcel,

ja das ist korrekt und der CRP Wert im Blut zeigt nur die globalen Entzündungen an. Die lokale Entzündung der Augen kann verschiedene Ursachen haben: z.B. verstopfte Tränenkanäle (u.a. Vitamin C, Astaxanthin und andere Antioxidantien einnehmen), ein evtl. Jodmangel, Erreger, Dysfunktion der Tränendrüsen, Augenlinse/Haftschalen. In einigen Fällen hilft auch Kokosöl (z.B. die Augenränder leicht einreiben): siehe auch "Sehkraftverlust jetzt stoppen" (Bruce Fife). Gute Besserung!

VG

Roger

Biologische Uhr beschleunigt
Wer vor 1990 geboren ist, altert langsamer

Zitat

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Lange ist die Lebenserwartung von Generation zu Generation gestiegen. Neue Daten zur biologischen Alterung stellen jedoch infrage, ob sich dieser Trend fortsetzt. Die in den 1990ern Geborenen altern schneller als frühere Jahrgänge.

Schnellere Alterung, mehr Krebs

Interessant ist, was die Forschenden daraus ableiten: Die biologische Alterung könnte ein Puzzlestück sein, um den Anstieg sogenannter früh auftretender Krebserkrankungen besser zu verstehen. Wie schnell verschiedene Körperbereiche altern, hing in den Resultaten mit bestimmten Krebsarten zusammen:

Beispielsweise stand die Alterung des Immunsystems mit dem Risiko für Lungenkrebs in Verbindung.
Für das alternde Fettgewebe zeigte sich ein Risiko für Darmkrebs.
Die Forschenden verweisen außerdem auf internationale Entwicklungen: In Australien, Kanada, dem Vereinigten Königreich (UK) und den USA ist das Risiko, an früh auftretendem Darmkrebs zu erkranken, für Menschen, die in den 1990er Jahren geboren wurden, mindestens viermal so hoch wie für diejenigen, die in den 1960er-Jahren zur Welt kamen.

Die neue Studie legt nahe, dass biologische Alterung ein Marker dafür sein könnte, wie sich Lebensstil und Umwelt langfristig auf den Körper auswirken. Die Forschenden unterstrichen allerdings auch: Die Ergebnisse belegen nicht, dass eine schnellere biologische Alterung direkt Krebs verursacht

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https://www.focus.de/gesundheit/longevit...4e62f89257.html