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Die epigenetische Altersuhr
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10.10.2022 09:14 (zuletzt bearbeitet: 10.10.2022 09:17)
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Epigenetic clock: A promising biomarker and practical tool in aging Zitat
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Antworten
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DunedinPACE, a DNA methylation biomarker of the pace of aging |
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Centenarians consistently present a younger epigenetic age than their chronological age with four epigenetic clocks based on a small number of CpG sites |
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Vielleicht ist das Buch schon hinreichend bekannt, aber falls nicht, empfehle ich es jetzt einfach |
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Loss of epigenetic information as a cause of mammalian aging |
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Zitat von Methusalem im Beitrag Populärwissenschaftliche News Man hat hier anscheinend ein Reperaturgen in die Zellen eingefügt und damit alte Mäuse (und solche, die künstlich gehaltert wurden) wieder flott gemacht. |
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Danke @Methusalem |
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Zitat von Methusalem im Beitrag Populärwissenschaftliche News Siehe auch: RE: News aus der Forschung (18) Eine Ursache von Demenz soll sein, dass sich Nervenzellen wie einzelne Zellen verhalten, schreibt u. a. Dr. Heininger. Spannend! |
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Zitat von Methusalem im Beitrag Populärwissenschaftliche News Entzündung, Demenz und Depression verbunden. Ich empfehle jeden die Lektüre. Wer mehr wissen will, der sollte hier gucken. |
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Erst Entzündung, dann kurze Telomere |
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Mit keinem Wort wird Epigrnetik in deinem Link erwähnt. Ansonsten deckt sich da der Strunz mit meiner Meinung, nur er will noch was verkaufen. |
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Alle bislang besprochenen epigenetischen Altersmessungen haben eins gemeinsam: Sie sind linear strukturiert. Zitat
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Zitat von Prometheus im Beitrag #113 Den Eindruck habe ich auch. Vielleicht liegt es aber auch daran, dass wir Menschen zu sehr nach dem Alter ihrer Haut und (unterbewusst) ihres Schädels beurteilen? Wenn jemand eingesackte Augen hat oder die Gesichtshaut durch die Sonne geschädigt ist, dann dürfte es selbst mit den gerade besten Interventionen schwierig werden, das merklich zu korrigieren. |
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Ja, genau: Ein Resetten des Zellalters ist zwar fundamental wichtig und hat definitiv auch einen großen Einfluss auf die Optik, aber gerade im Gesicht gibt es einige zusätzliche Altersmerkmale, die man separat berücksichtigen müsste. |
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#113 |
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Zitat von Prometheus im Beitrag #113 Aua meiner Sicht besteht das Grundproblem dieser Messungen darin, dass es keine Skala "Biologische Alterung" gibt. Man behilft sich mit dem Lebensalter. Wie ist "1 ALT" definiert? In der Physik ein Unding, Messwerte auf einer undefinierten Skala. Und es gibt nicht nur das Genom mit seinem Methylierungsmuster, es gibt auch die extrazellulare Matrix, z.B. Knochen, Knorpel, Bindegewebe, auch Haut etc. Wie heißt es: "Ab 40 ist jeder für sein Gesicht selbst verantwortlich" |
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Zitat von Dr.Faust im Beitrag #117 Bei der ersten Generation von Altersuhren (Horvath) ist die "Eichung" tatsächlich am kalendarischen Alter erfolgt, was eine Reihe von Nachteilen hat. Die neueren Uhren wie GrimAge basieren letztlich auf dem altersbedingten Mortalitätsrisiko, man hat also das Pferd von hinten aufgezäumt. Grob formuliert: GrimAge gibt dir an, wie viel " statistische Restlaufzeit" bei durchschnittlicher Alterungsgeschwindigkeit vorhanden ist. Der Zweck der Messung ist letztlich, diesen Puffer realistischer abzuschätzen und wieder zu vergrößern! |
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Ja mir ist das bekannt mit der "Restlaufzeit", war hier schon mal Thema. Erstens gefällt mir das nicht aus tiefenpsychologischen Gründen und wie groß ist die Stichprobe jeweils? |
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Zitat von Dr.Faust im Beitrag #119 Geht mir genauso, daher spreche ich lieber von einer variablen Pufferzone, die es zu vergrößern gilt! Wenn man die Differenz zwischen biologischem und kalendarischen Alter ermittelt, erhält man AgeAccelGrim, das in Einheiten/Jahr angegeben wird und eine Abschätzung ermöglicht, ob die Alterungsgeschwindigkeit langsamer oder schneller abläuft durchschnittlich (Durchschnitt ist definiert als 1 biologisches Lebensjahr pro Kalenderjahr). DNA methylation GrimAge strongly predicts lifespan and healthspan https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6366976/ Aus meiner Sicht wird auch hier noch nachgebessert werden müssen: Es macht wenig Sinn, die eigene Alterungsgeschwindigkeit als unabänderliche Konstante zu betrachten. Mittlerweile gibt es übrigens eine verbesserte Version von GrimAge, die nennt sich GrimAge2: DNA methylation GrimAge version 2 https://www.pure.ed.ac.uk/ws/portalfiles...Methylation.pdf Die statistische Methodik wird in dem Paper beschrieben. |
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Die Entwicklung präziserer epigenetischer Uhren findet gerade in einem atemberaubendem Tempo statt! |
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Ich kann leider deinen Link nicht öffnen. Gegen was werden die Uhren denn "geeicht"? |
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Habe den Link repariert. Ist ein aktuelles Preprint, also noch kein peer review! Die Eichung erfolgte in dieser Studie sowohl gegen das kalendarische Alter als auch gegen die originale epigenetische Horvath-Uhr. |
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The principal component-based clinical aging clock (PCAge) identifies signatures of healthy aging and provides normative targets for clinical intervention |
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Diese Studie zeigt, dass Elastic Net (EN) DNA-Methylierungsuhren (DNAme) eine geringe Vorhersagegenauigkeit für Personen gleichen Alters und eine geringe Auflösung zwischen gesunden und kranken Kohorten aufweisen; Vorbehalte, die mit der Anwendung linearer Modelle auf nichtlineare Prozesse verbunden sind. Wir fanden heraus, dass die Veränderung der Methylierung von Cytosinen mit dem Alter interessanterweise nicht ausschlaggebend für ihre Auswahl in den Uhren ist. Darüber hinaus ändern sich die ausgewählten Cytosine einer EN-Uhr, wenn Cytosine, die nicht in der Uhr enthalten sind, aus den Trainingsdaten entfernt werden; dies entspricht den Erwartungen an eine Optimierung im Kontext des maschinellen Lernens (ML), steht jedoch im Widerspruch zur Identifizierung von Gesundheitsmarkern in einem biologischen Kontext. Um diese Einschränkungen zu überwinden, sind wir von Vorhersagen zur Messung des biologischen Alters übergegangen und haben uns auf die Cytosine konzentriert, deren Methylierung im Durchschnitt über die gesamte Lebensspanne hinweg unverändert bleibt und von denen wir annehmen, dass sie homöostatisch lebenswichtig sind. Wir haben festgestellt, dass die Dysregulation solcher Cytosine, gemessen als Summe der Standardabweichungen ihrer Methylierungswerte, das biologische Rauschen quantifiziert, das nach unserer Hypothese ein Biomarker für Alterung und Krankheit ist. Wir nennen diesen Ansatz ein "Rauschbarometer" - den Druck, den Alterung und Krankheit auf einen Organismus ausüben. Diese Cytosine, die das Rauschen erkennen, sind besonders wichtig, da die Summen der SD auf den gesamten 450K-DNAme-Array-Daten ein zufälliges Muster durch die Chronologie ergeben. Bei der Prüfung, wie viele Cytosine der 450K-Arrays mit dem Alter verrauscht sind, haben wir festgestellt, dass das Paradigma des DNAme-Rauschens als Biomarker für Alterung und Krankheit sich bemerkenswerterweise in ~1/4 der Gesamtmenge manifestiert. In diesem großen Satz zeigen sogar die Cytosine, die im Durchschnitt eine konstante Methylierung im Alter aufweisen, erhöhte SDs und können als Rauschdetektoren des Barometers verwendet werden. |
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