RE: Omikron-Pandemie (Sars-CoV 2 B.1.1.529) - 3

Omicron variant of SARS-CoV-2 harbors a unique insertion mutation of putative viral or human genomic origin
Abbildungen und Infos aus ebendiesem Preprint:
https://osf.io/f7txy/

Unter den vielen Arbeiten, die nun in aller Eile zu Omicron erstellt werden, findet sich eine sehr gute Arbeit, die eine Ko-Produktion von Forschern aus den USA, Kanada und Indien ist. A.J. Venkatakrishnan, Praveen Anand, Patrick J. Lenehan, Rohit Suratekar, Bharathwaj Raghunathan, Michiel J. M. Nielsen und Venky Soundararajan haben sich b.1.1.529, Omicron genauer angesehen und zunächst einmal die Besonderheit von b.1.1.529, die in 37 (nicht wie bisher gedacht 32) Mutationen auf dem Spike-Protein besteht, genauer betrachtet.

Unter diesen 37 Mutationen gibt es 26 Mutationen, die sich bei keiner anderen Variant of Concern finden, die Omicron vorausgegangen sind, weder bei Alpha, noch bei Beta, Delta, Lambda usw. Das bemerkenswerte Ergebnis hat sich in einer schönen Abbildung niedergeschlagen:

Das ist nicht die einzige sehr schöne Abbildung, die einen informativen Gehalt hat und nicht nur ästhetische Bedürfnisse befriedigt, die man in dieser Arbeit finden kann. Die Besonderheit von Omicron wird in dieser Abbildung sehr deutlich. Omicron ist in der Tat etwas sehr Besonderes, denn eine der 26 Mutationen, die sich im Vergleich zu anderen Variants of Concern nur für Omicron finden, ist ein Insert / eine Einfügung: ins214EPE. An Position 214 im Spike-Protein von SARS-CoV-2 finden sich des öfteren Einfügungen, die Position scheint umkämpft zu sein, aber ins214EPE ist einmalig.

Wie einmalig?
Na einmalig eben: Venkatakrishnan haben 5.382.852 auf Github gespeicherte Genome von SARS-CoV-2, die 1.523 Pango Lineages zugeordnet werden, durchsucht und in keinem einzigen dieser vollständigen Genome ins214EPE gefunden. Das ist in der Tat einmalig. Alle sonstigen Mutationen, die Omicron von anderen Variants of Concern unterscheiden, finden sich in irgendwelchen anderen Varianten, nur ins214EPE nicht.

Wo kommt ins214EPE her?
Von HCoV-229E, einem Coronavirus, das jeden Winter unter Menschen verbreitet wird, gemeinhin zu einer ordinären Erkältung führt. 229E ist wohl unter den menschlichen Coronaviren das harmloseste, das nur dann zu schwerer Erkrankung führen kann, wenn es im Tandem mit einem anderen Coronavirus auftritt. Im Tandem mit einem der anderen Coronaviren aufzutreten, also mit HCoV-NL63, HCoV-OC43, HCoV-HKU1, MERS-CoV, SARS-CoV-1 oder SARS-CoV-2, das scheint 229E recht häufig zu tun, und bei einer dieser Zusammenkünfte scheinen 229E und SARS-CoV-2 Übereinkunft darüber erzielt zu haben, die Blaupause für die Replikation auszutauschen. “Template Switching” nennen Virologen diese Fähigkeit von Coronaviren, ihren Bauplan einfach auszutauschen und fortan ein Leben als das zu führen, was im Labor als Hybrid bekannt ist, eine Kreuzung aus 229E und SARS-CoV-2 im vorliegenden Fall. Damit zwei Coronaviren Pläne tauschen können, muss ein Organismus mit beiden Viren infiziert sein. Im Winter sicher kein Problem.

Was genau der Effekt dieses Tauschhandels mit 229E ist, ist derzeit noch unklar. Ob die höhere Übertragbarkeit, die SARS-CoV-2/Omicron im Vergleich zu anderen Varianten wohl auszeichnet, über dieses Insert zu erklären ist oder die vergleichsweise Harmlosigkeit, die SARS-CoV-2/Omicron in Gegensatz zu bisherigen Varianten von SARS-CoV-2 bringt, das ist unklar. Klar ist nur, dass es noch eine Masche gibt, mit der SARS-CoV-2 die Fähigkeit erwerben kann, Impfstoffen zu entgehen, über den Tausch von Bauplänen mit anderen menschlichen Coronaviren.

Was für Impfstoffhersteller eine schlechte Nachricht ist, ist zumindest für alle, die nicht geimpft sind, eine gute Nachricht, denn viele werden in der Vergangenheit mit hoher Wahrscheinlichkeit eine Erkältung mit 229E gehabt haben und daraus die entsprechenden in b-Zellen gespeicherten Informationen, die bei Bedarf in Immunität transferiert werden können, gewonnen haben. Ob dasselbe für Geimpfte zutrifft, ist eine Frage, zu deren Beantwortung man wissen müsste, welche dauerhaften Informationen als Ergebnis von Impfstoffen in b-Zellen gespeichert werden – wenn überhaupt.

Ihr wisse ja, ich hatte eine Studie hier im Forum verlinkt, dass jeder mit mindestens 2 oder 3 Coronavirenstämmen infiziert war. Ich finds nur leider nimmer. Hab wohl schon zu viel zu sARS-Cov-2 gepostet.
Ich werde mich vielleicht in Zukunft mehr auf die Gründe fokussieren, die gegen eine mRNA-"Impfung" sprechen.

Eine Kreuzung mit den endemischen CoVs?

Liegt das im Bereich des möglichen? Allerhand!

Zu Weihnachten noch n‘ Wälzer über Entwicklungsgeschichte von Viren.

Zitat von Dr.Faust im Beitrag #2267

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Wir wollen sie aber raus haben. Niespulver ???

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Zwei Dosen des Coronaimpfstoffs von Biontech und Pfizer scheinen einer groß angelegten Studie aus Südafrika zufolge einen deutlichen Schutz vor schweren Erkrankungen während der dortigen Omikron-Welle zu bieten. Die von Südafrikas größtem privaten Krankenversicherungsverwalter Discovery Health heute veröffentlichte Untersuchung basiert auf mehr als 211.000 positiven Testergebnissen zwischen dem 15. November und 7. Dezember, von denen etwa 78.000 auf die neue Virusvariante Omikron zurückgeführt wurden. Demnach bot eine zweifache Biontech-Impfung einen 70-prozentigen Schutz vor schweren Verläufen, die einen Krankenhausaufenthalt erforderlich machen, und von 33 Prozent vor einer Infektion.

Die Studienautoren gaben allerdings zu bedenken, dass es sich um vorläufige Ergebnisse aus den ersten drei Wochen der Omikron-Welle in Südafrika handele, die sich mit deren Ausweitung noch ändern könnten. Die Studie kam zu dem Schluss, dass das Risiko einer Neuinfektion während der vierten Welle in Südafrika höher war als bei früheren Wellen. Gleichzeitig sei das Risiko einer Krankenhauseinweisung bei Erwachsenen um 29 Prozent niedriger als bei der ersten Welle Anfang vergangenen Jahres. Bei Kindern scheine das Risiko einer Krankenhauseinweisung dagegen um 20 Prozent höher zu sein als in der ersten
Welle, die absolute Häufigkeit sei aber sehr niedrig.

Einzelne Berichte aus Krankenhäusern in Südafrika deuteten darauf hin, dass die meisten Covid-19-Diagnosen bei Kindern, die ins Krankenhaus eingeliefert wurden, zufällig festgestellt worden seien. Viele Kinder, die wegen anderer Erkrankungen ins Krankenhaus gekommen seien, würden bei Routine-Screening-Tests positiv getestet. Die Analyse von Discovery Health zeige zudem, dass das Risiko, dass Kinder positiv getestet werden, deutlich geringer gewesen sei als bei Erwachsenen. »

https://www.spiegel.de/wissenschaft/medi...a2-f15909aeef92

Hat mittlerweile schon jemand Daten zu Omikron von den anderen 3 Impfstoffen gesehen? Wenn Biontech mit Booster 4 fach unter Delta liegt, könnte ich mir bei Moderna einen besseren Schutz vorstellen mit vielleicht 2 fach. Interessant werden auch die Daten von Astrazenica und J & J.

Zitat von Speedy im Beitrag #2310

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Hat mittlerweile schon jemand Daten zu Omikron von den anderen 3 Impfstoffen gesehen? Wenn Biontech mit Booster 4 fach unter Delta liegt, könnte ich mir bei Moderna einen besseren Schutz vorstellen mit vielleicht 2 fach. Interessant werden auch die Daten von Astrazenica und J & J.

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BioNTech-Vizepräsidenting Katalin Karikó/BionTech zu Omikron

Ihr zufolge könnte Omikron das Ende der Epidemie bedeuten:

"Wenn es tatsächlich so ist, dass Omikron Delta verdrängen wird, weil es ansteckender ist, aber keine schweren Krankheiten verursacht, dann sollten wir uns keine Sorgen machen, ich bin sehr optimistisch" sagte Katalin Karikó im Radio Kossuth.
"Die Berichte aus Südafrika zeigen, dass die Zahl der Infizierten exponentiell gestiegen ist, der Zustand der Patienten aber nicht ernster geworden ist als bei der Delta-Variante. Die meisten der ins Krankenhaus eingelieferten Personen waren nicht geimpft, die in die Intensivstation eingelieferten Personen hatten andere Atemwegserkrankungen, aber bisher liegen nur wenige Daten vor. Wenn die Krankheit weiter verbreitet, aber weniger schwer wäre, wäre das gut, weil wir dann eine Herdenimmunität erreichen könnten", so die mit dem Széchenyi-Preis ausgezeichnete Wissenschaftlerin."/Quelle:Die Welt

Wer nicht bereits mit Delta infiziert war, sollte sich jetzt bemühen dass es nicht auf den letzten Metern passiert. Es bringt ja offensichtlich gegenüber Omikron keinen immunologischen Nutzen.

Omikron hingegen wird immer sympathischer!

Neueste Studie aus Südafrika. Hospitalisierungsrisiko von Omikron ~80% reduziert im Vergleich zu vorherigen Varianten !

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/...2.21.21268116v1

https://www.washingtonpost.com/world/202...onavirus-cases/

Davon ab:
Aus einigen ersten Datenanalysen aus Europa (auch vom RKI) scheint (!) sich womöglich eine Tendenz abzuleiten, dass „nur“ doppelt geimpfte sich eher oder symptomatischer mit Omikron infizieren als Ungeimpfte.

Gäbe es dafür eine halbwegs plausible hypothetische Erklärung (falls dem so wäre)?

Ergänzung zum obigen Beitrag:


Im Wochenbericht des Robert-Koch-Instituts von Donnerstag fehlt aufgrund der Datenlücke über die Feiertage die übliche Statistik über die „Impfdurchbrüche“. Dafür enthält er auf Seite 14 brisante neue Daten über die Ausbreitung der Omikron-Variante in Deutschland: Bei 6.788 Omikron-Fällen liegen Angaben über die Symptome vor – es seien „überwiegend keine oder milde Symptome“ aufgetreten. Die häufigsten Symptome sind Schnupfen, Husten und Halsschmerzen. 124 Patientinnen und Patienten wurden hospitalisiert, vier Person starben.
Vor allem aber über den Impfstatus der Omikron-Fälle gibt es neue Erkenntnisse: 95,6 Prozent der Omikron-Infizierten, für die eine Information über den Impfstatus vorliegt, waren vollständig geimpft. 27 Prozent hatten sogar bereits eine dritte, so genannte Booster-Impfung erhalten. Von 4.206 registrierten Fällen waren lediglich 186 ungeimpft.

Aus diesen Daten ergäbe sich sogar eine negative Wirksamkeit bei zwei Impfungen. Die dritte Impfung würde demnach zwar weiterhin vor einer Omikron-Infektion schützen – die Wirksamkeit liegt den Daten zufolge aber bei unter einem Drittel. Neueste Studien wiesen zuletzt daraufhin, dass zumindest die Booster-Impfung eine höhere Wirksamkeit gegen Omikron aufweist.

Diese Zahlen beziehen sich auf eine geringe Datenbasis, was einerseits auf die noch begrenzte Zahl an Omikron-Fällen in Deutschland zurückzuführen ist und andererseits auf den geringe Anteil der Corona-Fälle, die in Deutschland auf die Variante untersucht werden.

Zitat von Fichtennadel im Beitrag #63

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Ergänzung zum obigen Beitrag:


Im Wochenbericht des Robert-Koch-Instituts von Donnerstag fehlt aufgrund der Datenlücke über die Feiertage die übliche Statistik über die „Impfdurchbrüche“. Dafür enthält er auf Seite 14 brisante neue Daten über die Ausbreitung der Omikron-Variante in Deutschland: Bei 6.788 Omikron-Fällen liegen Angaben über die Symptome vor – es seien „überwiegend keine oder milde Symptome“ aufgetreten. Die häufigsten Symptome sind Schnupfen, Husten und Halsschmerzen. 124 Patientinnen und Patienten wurden hospitalisiert, vier Person starben.
Vor allem aber über den Impfstatus der Omikron-Fälle gibt es neue Erkenntnisse: 95,6 Prozent der Omikron-Infizierten, für die eine Information über den Impfstatus vorliegt, waren vollständig geimpft. 27 Prozent hatten sogar bereits eine dritte, so genannte Booster-Impfung erhalten. Von 4.206 registrierten Fällen waren lediglich 186 ungeimpft.

Aus diesen Daten ergäbe sich sogar eine negative Wirksamkeit bei zwei Impfungen. Die dritte Impfung würde demnach zwar weiterhin vor einer Omikron-Infektion schützen – die Wirksamkeit liegt den Daten zufolge aber bei unter einem Drittel. Neueste Studien wiesen zuletzt daraufhin, dass zumindest die Booster-Impfung eine höhere Wirksamkeit gegen Omikron aufweist.

Diese Zahlen beziehen sich auf eine geringe Datenbasis, was einerseits auf die noch begrenzte Zahl an Omikron-Fällen in Deutschland zurückzuführen ist und andererseits auf den geringe Anteil der Corona-Fälle, die in Deutschland auf die Variante untersucht werden.

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https://www.bihealth.org/de/aktuell/die-...en-bei-covid-19

Wissenschaftler*innen vom Berlin Institute of Health in der Charité (BIH) haben gemeinsam mit Kolleg*innen von der Charité – Universitätsmedizin Berlin sowie der Universitätskliniken in Bonn und Aachen bei schwer erkrankten COVID-19-Patient*innen eine besonders aktive Form von Immunzellen gefunden. Die CD16-positiven T-Zellen wirken verstärkt zytotoxisch, unter anderem auf die innere Zellschicht von Blutgefäßen. Gemeinsam mit Faktoren des Komplementsystems ist ihre Anwesenheit mit einem besonders fatalen Verlauf der Krankheit verbunden. Ihre Ergebnisse haben die Wissenschaftler*innen soeben in der Fachzeitschrift Cell veröffentlicht.

The SARS-CoV-2 variant, Omicron, shows rapid replication in human primary nasal epithelial cultures and efficiently uses the endosomal route of entry.
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.12.31.474653v1

OMIKRON-„WARNSIGNALE“
Verfärbte Lippen und Nägel als neue Symptome

Zitat

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Die aktuelle Omikron-Variante neigt zu Symptomen, die sich von den herkömmlichen Anzeichen einer Coronavirus-Infektion unterscheiden. So beobachten Ärzte und Forscher zum Beispiel blassgraue Lippen, Hautirritationen, verfärbte Nagelbette sowie Müdigkeit. Die amerikanische Gesundheitsbehörde sieht diese Symptome als „Warnsignal“. Sollten diese bei einem Menschen auftreten, sollte sich dieser schnellstmöglich in ärztliche Behandlung begeben.

Besorgniserregende Variante
Die Omikron-Variante wurde von der Weltgesundheitsorganisation (WHO) wegen der hohen Anzahl von S-Gen-Mutationen als besorgniserregende Variante eingestuft. Sie ist die am stärksten abweichende Variante, die während der Pandemie bisher in signifikanter Zahl nachgewiesen wurde. Sie dürfte nach den bisherigen wissenschaftlichen Daten mit einer erhöhten Übertragbarkeit, einer erheblichen Verringerung der Wirksamkeit des Impfstoffs und einem erhöhten Risiko für Reinfektionen verbunden sein.

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https://www.krone.at/2595425?fbclid=IwAR...YTFyuPTRAhCUDo8

Übrigens, frisch aus dem Nachrichtenticker:

Südafrika hat alle Covid-Restriktionen gestrichen wie Medien heute melden. Es habe weder eine alarmierende Veränderung bei der Zahl der Krankenhauseinweisungen, noch bei der Zahl der Todesfälle gegeben, so das zuständige Ministerium. In Südafrika sind nur knapp 27 Prozent der Bevölkerung geimpft. Quelle: Guidants News

Zitat von Prometheus im Beitrag #70

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Ja, stimmt. In Südafrika ist übrigens gerade Sommer.

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Zitat von Prometheus im Beitrag #72

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Denkst du, dass kann man einfach so auf eine überalterte Gesellschaft übertragen? Das Durchschnittsalter in Südafrika liegt bei 28 Jahren und viele dort haben bereits Schleimhaut-Immunität.
Das die aktuell geltenden Corona-Maßnahmen hierzulande nicht zielführend und teilweise völlig absurd sind, sehe ich allerdings genauso wie du.

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Die Debatte um eine Impfpflicht in D beginnt nächste Woche.

Dann müssen die Dinge ja endlich umrissen werden:
Wie viele Impfungen soll eine Impfpflicht umfassen? 2 oder jetzt 3?

Soll ein Omikron-Booster schon im Vorhinein verpflichtend gemacht werden? Nur einer oder auch mehrere?

Soll gar für jede kommende dominante Mutante eine Impfpflicht möglich gemacht werden, oder generell eine jährliche Auffrischung, ungeachtet der spezifischen Situation?

Die Dinge können nur klarer werden.
Man muss irgendwann auch pragmatisch definieren, welche Hospitalisierungsrate als in soweit erträglich angesehen wird, dass Testerei und Nachweise obsolet werden. Sonst endet „die Pandemie“ nie.